Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CenpjQ569L8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.26■■□□□ 1.8
CenpjQ569L8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpjQ569L8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms