Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snhg11Q4G0K9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snhg11Q4G0K9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snhg11Q4G0K9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snhg11Q4G0K9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Snhg11Q4G0K9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snhg11Q4G0K9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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