Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf38aQ4FK66 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf38aQ4FK66 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf38aQ4FK66 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms