Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt35Q497I4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt35Q497I4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt35Q497I4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms