Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim26Q3V460 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim26Q3V460 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms