Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Samd5Q3V1H9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd5Q3V1H9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd5Q3V1H9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms