Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc110Q3V125 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc110Q3V125 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms