Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

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Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnah12Q3V0Q1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnah12Q3V0Q1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnah12Q3V0Q1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnah12Q3V0Q1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnah12Q3V0Q1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnah12Q3V0Q1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnah12Q3V0Q1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnah12Q3V0Q1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnah12Q3V0Q1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnah12Q3V0Q1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms