Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ankrd53Q3V0J4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd53Q3V0J4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd53Q3V0J4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd53Q3V0J4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd53Q3V0J4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd53Q3V0J4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd53Q3V0J4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms