Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capn13Q3UW68 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn13Q3UW68 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms