Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpaQ3UU96 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdc42bpaQ3UU96 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdc42bpaQ3UU96 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdc42bpaQ3UU96 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms