Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp560Q3URI6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp560Q3URI6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms