Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbm20Q3UQS8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbm20Q3UQS8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms