Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E130208F15RikQ3UPV3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E130208F15RikQ3UPV3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms