Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbsponQ3UPR9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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