Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam198bQ3UPI1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam198bQ3UPI1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms