Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Skap2Q3UND0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skap2Q3UND0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Skap2Q3UND0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms