Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Cln5Q3UMW8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cln5Q3UMW8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cln5Q3UMW8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms