Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms