Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc33Q3ULW6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc33Q3ULW6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms