Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mccc2Q3ULD5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mccc2Q3ULD5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms