Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edc4Q3UJB9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Edc4Q3UJB9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Edc4Q3UJB9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms