Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed8Q3UHI4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed8Q3UHI4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms