Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Puf60Q3UEB3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Puf60Q3UEB3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms