Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem109Q3UBX0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem109Q3UBX0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms