Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U6N9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U6N9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3U6N9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U6N9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3U6N9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms