Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hectd3Q3U487 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms