Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf40Q3U319 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rnf40Q3U319 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf40Q3U319 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf40Q3U319 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf40Q3U319 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf40Q3U319 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms