Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc174Q3U155 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc174Q3U155 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms