Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem35bQ3U0Y2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem35bQ3U0Y2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmem35bQ3U0Y2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms