Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc9Q3U0M1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc9Q3U0M1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms