Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hace1Q3U0D9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hace1Q3U0D9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hace1Q3U0D9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms