Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc102aQ3TMW1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc102aQ3TMW1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms