Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2f1Q3THK3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2f1Q3THK3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2f1Q3THK3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms