Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc69Q3TCJ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms