Protein–RNA interactions for Protein: Q2VLH6

Cd163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, mousemouse

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd163Q2VLH6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd163Q2VLH6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms