Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim71Q1PSW8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim71Q1PSW8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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