Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpusd2Q149F1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms