Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf3ip1Q149C2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf3ip1Q149C2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms