Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Gli2Q0VGT2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Gli2Q0VGT2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms