Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cpne7Q0VE82 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne7Q0VE82 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms