Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb8Q0VBD0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb8Q0VBD0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms