Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid2Q0VBB0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms