Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn2bQ0KL01 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2bQ0KL01 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2bQ0KL01 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms