Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q08AU9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q08AU9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q08AU9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q08AU9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q08AU9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q08AU9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q08AU9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q08AU9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms