Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Runx2Q08775 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Runx2Q08775 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms