Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc4Q08624 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc4Q08624 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms