Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SctQ08535 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SctQ08535 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SctQ08535 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SctQ08535 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SctQ08535 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SctQ08535 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SctQ08535 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SctQ08535 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SctQ08535 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SctQ08535 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SctQ08535 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SctQ08535 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SctQ08535 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SctQ08535 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SctQ08535 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SctQ08535 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SctQ08535 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SctQ08535 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SctQ08535 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SctQ08535 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SctQ08535 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SctQ08535 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms