Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calb2Q08331 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms