Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgm3Q08189 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm3Q08189 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms